为构建珠江流域高质量国土空间格局，推动上-中-下游协调发展。文章以主体功能区战略为切入视角，运用交叉转换矩阵和多尺度地理加权回归模型，对1990—2020年珠江流域“三区空间”演化特征与驱动机制进行分析。结果表明：1）近30年间珠江流域城镇空间剧烈扩张，生态空间微增，但农业空间大量减少，上-中-下游“三区空间”演化空间差异显著；全域农业空间面积大幅减少，主要在下游地区转换为城镇空间，在上、中游地区恢复为生态空间；2）不同主体功能区中，城市化地区城镇空间增长最为剧烈，生态功能区生态空间恢复显著，农产品主产区农业空间大量减少；3）珠江流域“三区空间”演化受社会经济要素、自然地理要素和道路交通要素的共同驱动，不同驱动因子对于不同类型空间演化的作用强度存在明显差异，其中，产业发展大幅推动了城镇空间的扩张，而生态环境保护政策有力地推动重点生态区地生态空间恢复。